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Earth of fire

Actualité volcanique, Articles de fond sur étude de volcan, tectonique, récits et photos de voyage

Publié le par Bernard Duyck
Publié dans : #news
Yellowstone National Park - Lower geyser basin - Mushroom pool - Original photo National Park Service

Yellowstone National Park - Lower geyser basin - Mushroom pool - Original photo National Park Service

It is the microfauna - the thermophilic bacteria that live in hot springs - that provides some of the most important weapons in our fight against deadly diseases and viruses.

To understand this, we have to go back to 1966, during which Thomas Brock and his team at the University of Indiana studied the microorganisms in the hot springs of Yellowstone.

Samples of the microbial carpet taken at Muschroom spring / Lower geyser basin, the bacteria Thermus aquaticus strain YT-1 were isolated; this bacterium was studied in the 70s and 80s as part of the PCR - Polymerase Chain Reaction, and the thermo-stable enzyme taq DNA polymerase of Thermus aquaticus.

Bacterium Thermus Aquaticus, extracted from Mushroom pool Lower Geyser basin by Thomas Brock

Bacterium Thermus Aquaticus, extracted from Mushroom pool Lower Geyser basin by Thomas Brock

To better understand and fight against coronaviruses, we start with a sample from a person suspected of being infected, then extract the viral RNA from the sample. It is converted into DNA, then replicated with a PCR machine: the taq polymerase enzyme will make it possible to increase the quantity of DNA to be analyzed during successive heating and cooling cycles.

 

Without PCR, the race to count people infected and to develop a vaccine would be considerably hampered.

"Thanks to PCR, astonishing innovations, notably the sequencing of the human genome, genetic tests and the characterization of entire microbial communities around the world, have emerged, some of this research having even been crowned with a Nobel Prize!

Now, as our health care professionals struggle to determine the rates of infection and transmission and how to fight the new COVID-19 (and all future infectious diseases), we can look back at the research describing the microbes in them. Yellowstone hot springs to see how basic exploratory scientific research is of incredible benefit to humanity. "

 

Sources:

- USGS Caldera chronicles - How a thermophilic bacterium from a Yellowstone hot spring is helping the fight against the COVID-19 pandemic.

- Isolation of Thermus Strains from Hot Composts (60 to 80 ° C) - by Trello Beffa, Michel Blanc, Pierre-François Lyon, Gudrun Vogt, Marcelleo Marchiani, Johanna Lott Fischer, and Michel Aragno - Laboratory of Microbiology, University of Neuchâtel, CH-2007 Neuchâtel, Switzerland

- Biotechnological Applications of Thermus - by Peter L. Bergquist and Hugh W. Morgan

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Publié le par Bernard Duyck
Publié dans : #Nouvelle brève
Yellowstone National Park - Lower geyser basin - Mushroom pool -  Original photo  National Park Service

Yellowstone National Park - Lower geyser basin - Mushroom pool - Original photo National Park Service

C'est la microfaune - les bactéries thermophiles qui vivent dans les sources chaudes - qui fournit certaines des armes les plus importantes dans notre lutte contre les maladies mortelles et les virus .

 

Pour comprendre il faut remonter à l'année 1966, durant laquelle Thomas Brock et son équipe de l'université de l'Indiana étudient les micro-organismes des sources chaudes du Yellowstone.

Des échantillons du tapis microbien prélevé à Muschroom spring / Lower geyser basin, on a isolé la bactérie Thermus aquaticus souche YT-1 ; cette bactérie a été étudiée dans les années 70 et 80 dans le cadre de la PCR – Polymerase Chain Reaction, et de l'enzyme thermo-stable taq DNA polymerase du Thermus aquaticus.

Bacterie Thermus Aquaticus , extraite de Mushroom pool  Lower Geyser basin - Thomas Brock

Bacterie Thermus Aquaticus , extraite de Mushroom pool Lower Geyser basin - Thomas Brock

Pour mieux connaître les coronavirus, et lutter contre eux, on part d'un prélèvement sur une personne soupçonnée d'être infectée, puis on extrait l'ARN viral de l'échantillon. Il est converti en ADN, puis répliqué avec une machine de PCR : l'enzyme taq polymérase va permettre d'augmenter la quantité d'ADN à analyser lors de cycles successifs de chauffage et de refroidissement.

 

Sans PCR, la course au dénombrement des personnes infectées et au développement d'un vaccin serait considérablement entravée.

 

" Grâce à la PCR, des innovations étonnantes, notamment le séquençage du génome humain, des tests génétiques et la caractérisation de communautés microbiennes entières à travers le monde, ont vu le jour, certaines de ces recherches ayant même été couronnée par un prix Nobel !

Maintenant, alors que nos professionnels de la santé se démènent pour déterminer les taux d'infection et de transmission et comment combattre le nouveau COVID-19 (et toutes les futures maladies infectieuses), nous pouvons regarder en arrière la recherche décrivant les microbes dans les sources chaudes de Yellowstone pour voir comment la recherche scientifique exploratoire fondamentale est un avantage incroyable pour l'humanité."

 

Sources :

- USGS Caldera chronicles - How a thermophilic bacterium from a Yellowstone hot spring is helping the fight against the COVID-19 pandemic.

- Isolation of Thermus Strains from Hot Composts (60 to 80°C) - par Trello Beffa, Michel Blanc, Pierre-François Lyon, Gudrun Vogt, Marcelleo Marchiani, Johanna Lott Fischer, et Michel Aragno - Laboratoire de Microbiologie, Université de Neuchâtel, CH-2007 Neuchâtel, Switzerland

- Biotechnological Applications of Thermus - par Peter L. Bergquist et Hugh W. Morgan

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